2004年5月国药集团医药物流有限公司注册成立，注册资本3亿元人民币，是国药控股股份有限公司（香港上市股票代码HK1099）的全资子公司。在上海、北京、广州、天津、沈阳、武汉等地建有现代物流中心与配送中心体系。各大区域物流中心共拥有近10万平米的库房，运输车辆300多辆，其中冷藏车30辆，2011年货运价值量超过500个亿。 十二五期间，将陆续在全国完成40亿人民币的物流投资。
2012年，公司物流网络覆盖除西藏以外的全部省市，自有物流服务已覆盖全国30多个一级城市，100多个二、三级城市，2000多家商业公司，1万多家医院，10万多家药店及诊所，是中国网络覆盖最全的医药物流企业。同时国药物流还是国家一级抢险、救灾、军需、外援等药械商品的特种储备企业。
公司的核心第三方物流业务包括进口保税物流、药品物流、器械物流、冷链物流、零售物流、院内物流、临床试验物流和各类个性化的医药物流解决方案。公司主要采取一体化的多仓运营管理模式，通过不断整合资源，构建中国最广阔的医药物流服务网络。