四川科伦药物研究院始建于1998年，位于物华天宝，人杰地灵的天府之国—四川成都。研究院新建研发大楼已于2013年5月投入使用，一期占地面积36亩，总投资一亿多元。现拥有药物研究人员340余人，形成了从选题立项与合作、仿制与创新药物开发、药理和临床研究到项目注册与综合管理的18个专业技术部门,构建了从原料合成到项目申报的完整研发体系，建立以中央研究院（成都）为核心、以南方研究院（苏州）/北方研究院（天津）、海外研究院为分支机构，同时构建各生产企业研发团队的组织体系，并计划在未来2-3年内扩增至1000余人规模，形成由不同专业优秀科学家领军的、致力于创新和高技术内涵药物研究的国内一流研发团队。
科技创新是企业的核心竞争力，新形势下的科伦对产品研发和科技创新进行了战略再定位，采用“三发驱动”战略，尽快打造输液与非输液板块等强格局，形成愈战愈强的商场搏弈力量。“三发驱动”的意思是推动发展的三台发动机。
“第一发”—继续加大高端输液产品线的研发力度，进一步加强研制高附加值输液。目前科伦产品线已覆盖扩张血容量、电解质、麻醉、肠外营养、抗肿瘤、造影剂等领域，并在包装方面向双室袋、三室袋扩展。
“第二发”—加强抗生素产品的全产业链建设，完善抗生素产品线，掌握抗生素领域的全球话语权。
“第三发”—全面推进高端药物产品线，进行高技术内涵药物的研发。突出对临床急需的早仿、首仿药物、新型释药系统、创新型小分子和生物技术药物的研发。
四川科伦药物研究院建立了多个国家和省市级创新平台，包括国家级企业技术中心、国家地方联合工程实验室、国家大容量注射剂工程技术研究中心、国家博士后工作站、科伦创新药物孵化基地等。这些平台的建设，为企业奠定了良好的创新基础，使公司拥有了位列国内前茅的药物创新能力。
科伦药业在四川科伦药物研究院的基础上，已启动天津、苏州研究分院的组建工作，并在美国筹建全资子公司，打造海外分院，不断引进高端人才，迅速提升企业研发水平。同时研究院积极开展产学研合作，先后与北京大学、中国药科大学、沈阳药科大学、华东理工大学、四川大学、江西中医学院、成都中医药大学、四川省中医药科学院、四川抗菌素工业研究所等20多家医药研究机构建立了广泛、深入和长期的合作关系，充分利用知识联盟的作用提升科伦药业的研发实力。